Techniquement, la 996 marque l’apparition d’un moteur entièrement refroidi par eau, rompant avec la tradition des moteurs refroidis par air et par huile ; ce 6 cylindres, quelle que soit la cylindrée, bénéficie toujours du système à carter sec utilisé sur ses aînées. Le réservoir d’huile se trouvant sous le moteur et non séparé de ce dernier laisse suggérer à tort qu’il s’agit d’un carter humide.